Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
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NCOA1Q15788 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
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NCOA1Q15788 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
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NCOA1Q15788 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
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NCOA1Q15788 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
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NCOA1Q15788 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
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NCOA1Q15788 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA1Q15788 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
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