Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP13Q15645 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms