Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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SEC23BQ15437 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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SEC23BQ15437 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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SEC23BQ15437 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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SEC23BQ15437 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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SEC23BQ15437 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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SEC23BQ15437 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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