Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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