Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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PTPRRQ15256 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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PTPRRQ15256 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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PTPRRQ15256 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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