Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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