Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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ERV3-1Q14264 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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ERV3-1Q14264 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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ERV3-1Q14264 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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ERV3-1Q14264 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
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