Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
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