Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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