Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms