Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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