Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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TUBB3Q13509 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
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