Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
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SEMA3BQ13214 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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SEMA3BQ13214 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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SEMA3BQ13214 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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SEMA3BQ13214 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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