Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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