Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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IFT88Q13099 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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IFT88Q13099 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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IFT88Q13099 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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IFT88Q13099 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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IFT88Q13099 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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IFT88Q13099 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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IFT88Q13099 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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IFT88Q13099 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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IFT88Q13099 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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