Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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