Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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FOXD4Q12950 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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