Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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