Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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KCNMA1Q12791 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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KCNMA1Q12791 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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KCNMA1Q12791 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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KCNMA1Q12791 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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KCNMA1Q12791 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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KCNMA1Q12791 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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