Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms