Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms