Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms