Protein–RNA interactions for Protein: Q03519

TAP2, Antigen peptide transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP2Q03519 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAP2Q03519 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms