Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms