Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms