Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCCQ00597 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms