Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms