Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms