Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXO4P98177 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXO4P98177 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms