Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP1P63208 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP1P63208 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP1P63208 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP1P63208 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP1P63208 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP1P63208 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP1P63208 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP1P63208 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP1P63208 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP1P63208 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP1P63208 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP1P63208 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP1P63208 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP1P63208 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP1P63208 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP1P63208 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP1P63208 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKP1P63208 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKP1P63208 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP1P63208 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP1P63208 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP1P63208 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP1P63208 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP1P63208 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP1P63208 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP1P63208 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP1P63208 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms