Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms