Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVFC1-1P60608 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms