Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
ROMO1P60602 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms