Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP6P59044 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms