Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CABP4P57796 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CABP4P57796 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CABP4P57796 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CABP4P57796 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CABP4P57796 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CABP4P57796 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CABP4P57796 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CABP4P57796 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CABP4P57796 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CABP4P57796 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CABP4P57796 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CABP4P57796 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CABP4P57796 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CABP4P57796 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CABP4P57796 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CABP4P57796 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CABP4P57796 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CABP4P57796 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CABP4P57796 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CABP4P57796 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CABP4P57796 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CABP4P57796 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CABP4P57796 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CABP4P57796 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CABP4P57796 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CABP4P57796 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CABP4P57796 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CABP4P57796 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CABP4P57796 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CABP4P57796 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CABP4P57796 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CABP4P57796 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CABP4P57796 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CABP4P57796 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CABP4P57796 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CABP4P57796 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CABP4P57796 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CABP4P57796 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CABP4P57796 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CABP4P57796 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CABP4P57796 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CABP4P57796 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CABP4P57796 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CABP4P57796 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CABP4P57796 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CABP4P57796 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CABP4P57796 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CABP4P57796 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CABP4P57796 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CABP4P57796 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CABP4P57796 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CABP4P57796 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CABP4P57796 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CABP4P57796 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CABP4P57796 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CABP4P57796 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CABP4P57796 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CABP4P57796 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CABP4P57796 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CABP4P57796 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CABP4P57796 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CABP4P57796 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CABP4P57796 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CABP4P57796 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CABP4P57796 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CABP4P57796 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CABP4P57796 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CABP4P57796 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CABP4P57796 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CABP4P57796 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CABP4P57796 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABP4P57796 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABP4P57796 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABP4P57796 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABP4P57796 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABP4P57796 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABP4P57796 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABP4P57796 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABP4P57796 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABP4P57796 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABP4P57796 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABP4P57796 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABP4P57796 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABP4P57796 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABP4P57796 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABP4P57796 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABP4P57796 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABP4P57796 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABP4P57796 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABP4P57796 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABP4P57796 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABP4P57796 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABP4P57796 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABP4P57796 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABP4P57796 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABP4P57796 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABP4P57796 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABP4P57796 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABP4P57796 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms