Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms