Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP107P57740 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP107P57740 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP107P57740 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP107P57740 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP107P57740 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP107P57740 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP107P57740 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP107P57740 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP107P57740 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP107P57740 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP107P57740 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP107P57740 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP107P57740 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP107P57740 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP107P57740 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP107P57740 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP107P57740 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP107P57740 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP107P57740 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP107P57740 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP107P57740 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP107P57740 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP107P57740 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP107P57740 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP107P57740 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP107P57740 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NUP107P57740 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP107P57740 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP107P57740 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP107P57740 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP107P57740 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP107P57740 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP107P57740 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP107P57740 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP107P57740 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP107P57740 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP107P57740 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP107P57740 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP107P57740 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP107P57740 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP107P57740 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP107P57740 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP107P57740 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP107P57740 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP107P57740 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP107P57740 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP107P57740 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP107P57740 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP107P57740 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP107P57740 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP107P57740 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP107P57740 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP107P57740 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP107P57740 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP107P57740 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP107P57740 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms