Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME5P56597 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME5P56597 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME5P56597 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NME5P56597 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME5P56597 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME5P56597 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms