Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PAX9P55771 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PAX9P55771 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PAX9P55771 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PAX9P55771 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PAX9P55771 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX9P55771 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PAX9P55771 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX9P55771 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX9P55771 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PAX9P55771 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PAX9P55771 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX9P55771 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX9P55771 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PAX9P55771 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PAX9P55771 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PAX9P55771 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX9P55771 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PAX9P55771 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PAX9P55771 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX9P55771 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX9P55771 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PAX9P55771 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PAX9P55771 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX9P55771 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PAX9P55771 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX9P55771 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PAX9P55771 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX9P55771 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX9P55771 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX9P55771 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PAX9P55771 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX9P55771 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX9P55771 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX9P55771 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX9P55771 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PAX9P55771 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX9P55771 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX9P55771 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PAX9P55771 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX9P55771 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PAX9P55771 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX9P55771 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX9P55771 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PAX9P55771 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX9P55771 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PAX9P55771 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PAX9P55771 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX9P55771 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX9P55771 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PAX9P55771 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PAX9P55771 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms