Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP7P55210 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP7P55210 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP7P55210 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP7P55210 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP7P55210 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP7P55210 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP7P55210 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP7P55210 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP7P55210 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP7P55210 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP7P55210 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP7P55210 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP7P55210 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP7P55210 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP7P55210 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP7P55210 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP7P55210 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP7P55210 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP7P55210 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP7P55210 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP7P55210 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP7P55210 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP7P55210 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP7P55210 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP7P55210 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP7P55210 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP7P55210 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP7P55210 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP7P55210 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP7P55210 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP7P55210 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP7P55210 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP7P55210 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP7P55210 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP7P55210 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP7P55210 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP7P55210 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP7P55210 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP7P55210 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP7P55210 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP7P55210 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP7P55210 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP7P55210 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP7P55210 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP7P55210 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP7P55210 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP7P55210 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP7P55210 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP7P55210 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP7P55210 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP7P55210 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP7P55210 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP7P55210 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP7P55210 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP7P55210 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP7P55210 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP7P55210 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP7P55210 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP7P55210 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP7P55210 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP7P55210 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP7P55210 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP7P55210 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP7P55210 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP7P55210 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP7P55210 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP7P55210 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP7P55210 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP7P55210 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP7P55210 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP7P55210 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP7P55210 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP7P55210 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP7P55210 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP7P55210 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP7P55210 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP7P55210 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP7P55210 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP7P55210 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP7P55210 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP7P55210 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP7P55210 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP7P55210 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP7P55210 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP7P55210 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP7P55210 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP7P55210 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP7P55210 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP7P55210 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP7P55210 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP7P55210 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP7P55210 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP7P55210 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP7P55210 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP7P55210 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP7P55210 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP7P55210 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP7P55210 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP7P55210 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms