Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOSBP53539 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOSBP53539 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOSBP53539 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FOSBP53539 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FOSBP53539 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOSBP53539 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOSBP53539 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOSBP53539 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOSBP53539 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOSBP53539 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOSBP53539 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOSBP53539 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOSBP53539 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOSBP53539 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOSBP53539 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FOSBP53539 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOSBP53539 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOSBP53539 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOSBP53539 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOSBP53539 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOSBP53539 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOSBP53539 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOSBP53539 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FOSBP53539 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOSBP53539 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FOSBP53539 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOSBP53539 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOSBP53539 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOSBP53539 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOSBP53539 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOSBP53539 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOSBP53539 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FOSBP53539 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOSBP53539 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOSBP53539 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOSBP53539 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOSBP53539 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOSBP53539 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOSBP53539 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOSBP53539 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOSBP53539 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOSBP53539 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOSBP53539 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOSBP53539 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOSBP53539 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOSBP53539 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOSBP53539 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOSBP53539 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOSBP53539 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOSBP53539 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOSBP53539 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FOSBP53539 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOSBP53539 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOSBP53539 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOSBP53539 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOSBP53539 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FOSBP53539 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FOSBP53539 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOSBP53539 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOSBP53539 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOSBP53539 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOSBP53539 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOSBP53539 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOSBP53539 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FOSBP53539 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FOSBP53539 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FOSBP53539 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FOSBP53539 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FOSBP53539 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FOSBP53539 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FOSBP53539 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOSBP53539 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOSBP53539 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FOSBP53539 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOSBP53539 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOSBP53539 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOSBP53539 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOSBP53539 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FOSBP53539 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOSBP53539 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOSBP53539 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FOSBP53539 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOSBP53539 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOSBP53539 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOSBP53539 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOSBP53539 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOSBP53539 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOSBP53539 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOSBP53539 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOSBP53539 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FOSBP53539 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOSBP53539 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FOSBP53539 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOSBP53539 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOSBP53539 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOSBP53539 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOSBP53539 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOSBP53539 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOSBP53539 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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