Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGDP52209 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGDP52209 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGDP52209 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGDP52209 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGDP52209 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGDP52209 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGDP52209 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGDP52209 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGDP52209 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PGDP52209 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGDP52209 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGDP52209 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGDP52209 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGDP52209 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGDP52209 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGDP52209 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGDP52209 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGDP52209 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGDP52209 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGDP52209 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGDP52209 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGDP52209 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PGDP52209 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGDP52209 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGDP52209 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGDP52209 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGDP52209 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGDP52209 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGDP52209 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGDP52209 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGDP52209 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGDP52209 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGDP52209 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGDP52209 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGDP52209 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGDP52209 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGDP52209 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGDP52209 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGDP52209 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGDP52209 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PGDP52209 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGDP52209 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGDP52209 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGDP52209 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGDP52209 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGDP52209 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGDP52209 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGDP52209 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGDP52209 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGDP52209 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGDP52209 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGDP52209 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGDP52209 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGDP52209 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGDP52209 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGDP52209 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PGDP52209 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PGDP52209 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGDP52209 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGDP52209 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGDP52209 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGDP52209 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGDP52209 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGDP52209 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PGDP52209 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PGDP52209 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms