Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLK1P49759 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLK1P49759 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLK1P49759 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CLK1P49759 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLK1P49759 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CLK1P49759 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLK1P49759 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLK1P49759 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLK1P49759 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CLK1P49759 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLK1P49759 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLK1P49759 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLK1P49759 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLK1P49759 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLK1P49759 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLK1P49759 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLK1P49759 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLK1P49759 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLK1P49759 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLK1P49759 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLK1P49759 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLK1P49759 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLK1P49759 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLK1P49759 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLK1P49759 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLK1P49759 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CLK1P49759 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLK1P49759 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CLK1P49759 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLK1P49759 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLK1P49759 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CLK1P49759 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLK1P49759 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLK1P49759 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms