Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPAP49450 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPAP49450 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPAP49450 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPAP49450 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPAP49450 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPAP49450 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPAP49450 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPAP49450 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPAP49450 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CENPAP49450 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPAP49450 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPAP49450 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPAP49450 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPAP49450 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPAP49450 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPAP49450 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPAP49450 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPAP49450 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPAP49450 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPAP49450 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPAP49450 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPAP49450 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPAP49450 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPAP49450 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPAP49450 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPAP49450 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPAP49450 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPAP49450 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPAP49450 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPAP49450 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPAP49450 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPAP49450 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPAP49450 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPAP49450 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPAP49450 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPAP49450 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPAP49450 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPAP49450 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPAP49450 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPAP49450 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPAP49450 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPAP49450 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPAP49450 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPAP49450 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPAP49450 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPAP49450 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPAP49450 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPAP49450 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPAP49450 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPAP49450 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPAP49450 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPAP49450 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPAP49450 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPAP49450 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPAP49450 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPAP49450 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPAP49450 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPAP49450 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPAP49450 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPAP49450 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPAP49450 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPAP49450 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPAP49450 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPAP49450 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPAP49450 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPAP49450 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPAP49450 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPAP49450 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPAP49450 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPAP49450 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPAP49450 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms