Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFMP43652 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFMP43652 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFMP43652 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFMP43652 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFMP43652 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFMP43652 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFMP43652 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFMP43652 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFMP43652 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFMP43652 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFMP43652 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
AFMP43652 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
AFMP43652 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFMP43652 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFMP43652 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFMP43652 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
AFMP43652 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFMP43652 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFMP43652 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFMP43652 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFMP43652 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFMP43652 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFMP43652 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFMP43652 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFMP43652 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFMP43652 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFMP43652 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFMP43652 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFMP43652 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFMP43652 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFMP43652 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFMP43652 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFMP43652 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFMP43652 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFMP43652 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFMP43652 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFMP43652 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFMP43652 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFMP43652 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFMP43652 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFMP43652 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AFMP43652 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFMP43652 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFMP43652 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFMP43652 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFMP43652 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFMP43652 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AFMP43652 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AFMP43652 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AFMP43652 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AFMP43652 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AFMP43652 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AFMP43652 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AFMP43652 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AFMP43652 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AFMP43652 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AFMP43652 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AFMP43652 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AFMP43652 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AFMP43652 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AFMP43652 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AFMP43652 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AFMP43652 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AFMP43652 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AFMP43652 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AFMP43652 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AFMP43652 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AFMP43652 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AFMP43652 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AFMP43652 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AFMP43652 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
AFMP43652 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AFMP43652 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AFMP43652 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AFMP43652 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AFMP43652 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AFMP43652 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AFMP43652 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AFMP43652 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AFMP43652 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AFMP43652 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AFMP43652 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AFMP43652 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AFMP43652 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AFMP43652 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AFMP43652 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AFMP43652 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AFMP43652 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AFMP43652 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AFMP43652 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AFMP43652 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AFMP43652 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AFMP43652 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AFMP43652 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AFMP43652 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AFMP43652 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AFMP43652 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AFMP43652 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AFMP43652 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms