Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MDH1P40925 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDH1P40925 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDH1P40925 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDH1P40925 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDH1P40925 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDH1P40925 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MDH1P40925 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDH1P40925 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDH1P40925 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDH1P40925 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDH1P40925 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDH1P40925 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDH1P40925 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDH1P40925 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDH1P40925 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDH1P40925 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDH1P40925 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDH1P40925 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDH1P40925 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDH1P40925 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDH1P40925 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDH1P40925 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MDH1P40925 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDH1P40925 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDH1P40925 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDH1P40925 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDH1P40925 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDH1P40925 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDH1P40925 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDH1P40925 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDH1P40925 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MDH1P40925 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDH1P40925 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDH1P40925 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDH1P40925 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDH1P40925 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MDH1P40925 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MDH1P40925 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MDH1P40925 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MDH1P40925 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MDH1P40925 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MDH1P40925 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MDH1P40925 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MDH1P40925 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MDH1P40925 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MDH1P40925 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MDH1P40925 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MDH1P40925 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MDH1P40925 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MDH1P40925 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MDH1P40925 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MDH1P40925 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MDH1P40925 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MDH1P40925 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MDH1P40925 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MDH1P40925 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MDH1P40925 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MDH1P40925 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MDH1P40925 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MDH1P40925 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MDH1P40925 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MDH1P40925 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MDH1P40925 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MDH1P40925 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MDH1P40925 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MDH1P40925 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDH1P40925 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDH1P40925 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDH1P40925 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDH1P40925 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDH1P40925 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDH1P40925 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDH1P40925 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDH1P40925 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDH1P40925 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDH1P40925 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDH1P40925 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDH1P40925 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDH1P40925 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDH1P40925 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDH1P40925 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDH1P40925 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDH1P40925 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDH1P40925 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDH1P40925 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDH1P40925 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDH1P40925 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDH1P40925 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDH1P40925 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDH1P40925 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDH1P40925 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDH1P40925 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDH1P40925 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDH1P40925 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDH1P40925 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDH1P40925 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDH1P40925 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDH1P40925 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDH1P40925 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms