Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms