Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBRP36941 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBRP36941 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBRP36941 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBRP36941 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBRP36941 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBRP36941 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBRP36941 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBRP36941 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBRP36941 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBRP36941 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBRP36941 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBRP36941 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBRP36941 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBRP36941 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBRP36941 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBRP36941 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBRP36941 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBRP36941 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBRP36941 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBRP36941 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBRP36941 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBRP36941 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBRP36941 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBRP36941 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBRP36941 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBRP36941 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBRP36941 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBRP36941 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBRP36941 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBRP36941 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBRP36941 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBRP36941 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBRP36941 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBRP36941 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBRP36941 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBRP36941 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBRP36941 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBRP36941 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBRP36941 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBRP36941 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTBRP36941 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LTBRP36941 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LTBRP36941 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LTBRP36941 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LTBRP36941 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTBRP36941 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTBRP36941 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTBRP36941 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTBRP36941 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LTBRP36941 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTBRP36941 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTBRP36941 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTBRP36941 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTBRP36941 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTBRP36941 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LTBRP36941 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTBRP36941 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTBRP36941 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LTBRP36941 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LTBRP36941 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBRP36941 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBRP36941 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBRP36941 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBRP36941 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms