Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTKP29376 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTKP29376 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTKP29376 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LTKP29376 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTKP29376 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTKP29376 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTKP29376 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTKP29376 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTKP29376 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LTKP29376 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LTKP29376 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LTKP29376 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LTKP29376 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTKP29376 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTKP29376 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTKP29376 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTKP29376 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTKP29376 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTKP29376 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTKP29376 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTKP29376 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTKP29376 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTKP29376 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTKP29376 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTKP29376 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTKP29376 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTKP29376 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTKP29376 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTKP29376 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTKP29376 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTKP29376 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTKP29376 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTKP29376 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTKP29376 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTKP29376 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LTKP29376 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LTKP29376 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTKP29376 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTKP29376 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTKP29376 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTKP29376 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTKP29376 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTKP29376 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTKP29376 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTKP29376 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTKP29376 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTKP29376 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTKP29376 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTKP29376 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTKP29376 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LTKP29376 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTKP29376 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTKP29376 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTKP29376 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTKP29376 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LTKP29376 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTKP29376 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTKP29376 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTKP29376 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTKP29376 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTKP29376 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTKP29376 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTKP29376 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTKP29376 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTKP29376 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTKP29376 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTKP29376 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LTKP29376 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTKP29376 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LTKP29376 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTKP29376 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTKP29376 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTKP29376 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTKP29376 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTKP29376 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTKP29376 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTKP29376 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTKP29376 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTKP29376 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTKP29376 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTKP29376 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTKP29376 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTKP29376 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTKP29376 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTKP29376 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTKP29376 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTKP29376 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTKP29376 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTKP29376 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTKP29376 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTKP29376 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTKP29376 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LTKP29376 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTKP29376 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTKP29376 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTKP29376 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTKP29376 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTKP29376 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTKP29376 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms