Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTFRP26992 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTFRP26992 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTFRP26992 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTFRP26992 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTFRP26992 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTFRP26992 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTFRP26992 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTFRP26992 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTFRP26992 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTFRP26992 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTFRP26992 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTFRP26992 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTFRP26992 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTFRP26992 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTFRP26992 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTFRP26992 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTFRP26992 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNTFRP26992 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTFRP26992 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTFRP26992 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTFRP26992 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTFRP26992 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTFRP26992 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTFRP26992 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTFRP26992 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTFRP26992 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTFRP26992 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTFRP26992 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTFRP26992 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTFRP26992 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTFRP26992 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTFRP26992 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTFRP26992 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTFRP26992 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTFRP26992 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTFRP26992 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTFRP26992 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTFRP26992 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTFRP26992 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTFRP26992 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTFRP26992 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTFRP26992 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTFRP26992 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTFRP26992 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTFRP26992 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTFRP26992 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTFRP26992 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTFRP26992 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTFRP26992 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTFRP26992 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTFRP26992 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTFRP26992 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTFRP26992 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTFRP26992 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms